Москва, Старокалужское шоссе, 62

Пн - пт: 8:00 - 20:00

Сб: 9:00 - 18:00

Вск: 9:00 - 18:00 (только приём материала)

+7 499 677-52-22 report@progen.ru Написать в поддержку
Технология
7 мая 2022 год

NGS

Что такое NGS?

NGS или Next-generation sequencing переводится как "секвенирование следующего поколения" или "секвенирование нового поколения". Это технология массового параллельного секвенирования, которая обеспечивает сверхвысокую пропускную способность, масштабируемость и скорость. Её можно использовать для определения порядка нуклеотидов во всех геномах или целевых областях ДНК или РНК. Внедрение NGS значительно расширило наши исследовательские возможности, сделав медицинскую генетику намного более информативной, благодаря значительному увеличению глубины прочтения ДНК.

photo_2022-05-08_18-37-14.jpg

Где применяется эта технология?

NGS превосходит любые другие виды секвенирования, поэтому сейчас генетики могут ответить на те вопросы, которые ещё недавно не могли даже задать. NGS применяется не только в пренатальной и семейной генетике, но и в других областях.

С помощью NGS лаборатории:

Секвенируют целые геномы.

Глубоко секвенируют отдельные участки и регионы.

Секвенируют РНК (RNA-Seq) для обнаружения новых вариантов РНК и сайтов сплайсинга или количественного определения мРНК для анализа экспрессии генов

Анализируют эпигенетические факторы, такие как метилирование ДНК по всему геному и взаимодействие ДНК с белками.

Мы используем NGS от компании Illumina

Рабочий процесс NGS Illumina состоит из 4 основных шагов:

1. Подготовка библиотеки

Библиотека секвенирования готовится путем случайной фрагментации образца ДНК или кДНК с последующей адаптацией. В другом случае, "маркировка" объединяет реакции фрагментации и лигирования в один этап, что значительно повышает эффективность процесса подготовки библиотеки. Фрагменты, лигированные адаптером, затем размножаются и очищаются гелем.

2. Кластеризация

Далее библиотека загружается в проточную ячейку, где фрагменты захватываются на поле из поверхностно связанных олиго, комплементарных к адаптерам библиотеки. Каждый фрагмент затем амплифицируется в четкие клональные кластеры посредством мостовой амплификации. Когда кластеризация завершена, шаблоны готовы к упорядочиванию.

3. Секвенирование

Технология Illumina SBS использует запатентованный метод, основанный на обратимых терминаторах, который обнаруживает одиночные основания, поскольку они включены в нити матрицы ДНК. Поскольку все четыре обратимых DNTP, связанных с терминатором, присутствуют во время каждого цикла секвенирования, естественная конкуренция сводит к минимуму смещение включения и значительно снижает частоту необработанных ошибок по сравнению с другими технологиями.

4. Анализ данных

Во время анализа данных и выравнивания вновь идентифицированные последовательности считываются в соответствии с эталонным геномом. После выравнивания возможны другие варианты анализа, такие как идентификация однонуклеотидного полиморфизма (SNP) или инсерции-делеции (indel), подсчет показаний по методикам, филогенетический или метагеномный анализ и многое другое.

Технологии по этой теме

Все технологии

Обследования на тему